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中心配有全自动生化仪、全自动血细胞分析仪、化学发光免疫分析仪、全自动免疫印迹仪、实时荧光定量PCR仪、核酸提取工作站、全自动病毒载量检测系统、全自动微生物质谱检测系统等290余台件仪器设备；建有艾滋病确证、结核菌、病原微生物、病毒检测四个二级生物安全实验室。
